阿尔达布拉位于马埃岛西南方一千多公里处，与其说是普通的海岛旅游地，不如说是一个远离日常世界的地方。四座主要珊瑚石灰岩岛围绕浅潟湖，狭窄水道将潟湖与印度洋相连。塞舌尔群岛基金会称环礁约长35公里、宽15公里；联合国教科文组织列出的世界遗产保护面积为3.5万公顷。海洋景观与保护区域共同构成生态系统，这里并非只有一片海滩。
阿尔达布拉是隆起的珊瑚环礁，由古老珊瑚礁石灰岩构成，曾多次高出海平面。每天两次，潮汐穿过水道，改变岸线、滩地和红树林湿地。崎岖的石灰岩表面有时被称为“蘑菇地形”，因其外形像蘑菇，形成多样栖息地。潟湖、珊瑚礁、海草床、红树林和干燥灌木地在难以抵达的环境中交错分布，许多自然过程仍清晰可见。